Les Unités de Formation et de Recherche
- Droit et Science Politique
Directrice : Laurence Ravillon | Responsable administrative : Sandrine Bocquet-Roustan
- Langues et Communication
Directrice : Marie-Geneviève Gerrer | Responsable administrative : Sylvie Iniesta
- Lettres et Philosophie
Directeur : Philippe Monneret | Responsable administratif : Youssef El-Hanbali
- Médecine
Directeur : Frédéric Huet | Responsable administrative : Anne-Marie Ballot
- Science Economique et de Gestion
Directeur : Stéphane Tizio | Responsable administrative : Sandrine Bocquet-Roustan
- Sciences du Sport (STAPS)
Directeur : Jean-Pierre Rey | Responsable administrative : Tania Carnet
- Sciences et Techniques
Directeur : Thierry Grison | Responsable administratif : Jean-Pierre Billot
- Sciences Humaines
Directeur : Daniel Durney | Responsable administratif : Youssef El-Hanbali
- Sciences Pharmaceutiques et Biologiques (pharmacie)
Directrice : Evelyne Kohli | Responsable administrative : Guylaine Racouchot
- Sciences Vie, Terre et Environnement
Directeur : Michel Narce | Responsable administratif : Florent Sala
Les écoles
- Ecole Supérieure d’Ingénieurs de Recherche en Matériaux (ESIREM)
Directeur : Gilles Caboche | Responsable administrative : Sylvie Diemand
- Institut Universitaire de Formation des Maîtres (IUFM) de Bourgogne
Directeur : Sophie Genelot | Responsable administrative : Coralie Fischer
Les instituts
- Institut d’Administration des Entreprises (IAE)
Directeur : Grégory Wegmann
- Institut de la Vigne et du Vin Jules Guyot (IUVV)
Directrice : Michèle Guilloux-Benatier | Responsable administrative : Christine Marget
- Institut Universitaire de Technologie de Dijon-Auxerre
Directeur : Marcel Grenard | Responsable administratif : Denys Martre
- Institut Universitaire de Technologie de Chalon-sur-Saône
Directeur : Pascal Mauny | Responsable administrative : Anita Chalmeau
- Institut Universitaire de Technologie du Creusot
Directeur : Patrick Gorria | Responsable administrative : Catherine Biniek
- IUP Ingénierie en Documentation d’Entreprise, Réseaux et Images (IDERI)
Directeur : (Info en attente)
- Institut Denis Diderot : Management de l’éducation, de la formation et de la Culture
Directeur : Daniel Durney | Responsable administratif : Jean-Philippe Thony
- Institut Supérieur de l’Automobile et des Transports (ISAT)
Directeur : Luis Le Moyne | Responsable administratif : Régine Lacour
