Les écoles doctorales sont des structures pédagogiques regroupant les différentes unités de recherche labellisées et ayant en charge la formation des doctorants et la préparation de leur insertion professionnelle.
École doctorale Carnot Pasteur
Directeur : Hans Rudolf JAUSLIN (uB) / Directeur adjoint : Louis JEANJEAN (UFC)
ED SPIM : SCIENCES POUR L’INGÉNIEUR ET MICROTECHNIQUE
Directeur : Thérèse LEBLOIS / Directeur adjoint : Patrick MARQUIE
ED DGEP : DROIT, GESTION, ÉCONOMIE ET POLITIQUE
Direction : Bernard Quiriny / Karine Brisset
ED ES : ENVIRONNEMENTS SANTÉ
Directeur : Thierry RIGAUD
ED LECLA : LETTRES, COMMUNICATION, LANGUES, ARTS
Direction : Agnès Alexandre Collier / Pascal Lecroart
ED SEPT : SOCIÉTÉS, ESPACE, PRATIQUES, TEMPS
Direction : André Didierjean / Michel Nicolas
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